| 蛋白质与RNA 相互作用的预测和研究 |
| 点此下载全文 |
| 引用本文：王彤, 薛建新, 杜奕.蛋白质与RNA 相互作用的预测和研究[J].上海第二工业大学(中文版),2017,(3):0 |
| 摘要点击次数: 785 |
| 全文下载次数: 1126 |
|
|
| 中文摘要:确定蛋白质与RNA 是否发生作用非常重要, 因为它广泛存在于生物学过程中, 在生物体细胞活动中起到至关重要的作用。特别是近几年随着蛋白质结构数据的增多, 如果仍用传统的物理化学方法去测定会非常困难, 找到能自动预测蛋白质与RNA 的相互作用的方法迫在眉睫。首先采用PsePSSM 算法表达蛋白质序列, 编码后的蛋白质特征向量维数很高; 接着采用GPP 流形学习方法对其进行维数约简, 约简后的特征向量输入SVM 分类器训练, 训练好的分类器预测未知的蛋白质与RNA 是否相互作用; 最后, 采用Jackknife 测试方法检验预测准确率, 测试结果表明, 上述方法是十分有效的, 为蛋白质与RNA 是否相互作用的研究提供一条新的思路。 |
| 中文关键词:蛋白质与RNA 相互作用 维数约简 预测 |
| |
|
|
| 查看全文 查看/发表评论 下载PDF阅读器 |
|
|
|